Fernando Rubio ha cesado de su cargo de director de Acción Exterior de la Consejería de la Presidencia de la Junta de Castilla y León, a petición propia, y ha sido nombrado nuevo director de la Agencia de Innovación y Desarrollo Económico del Ayuntamiento de Valladolid.
Su cese fue aprobado en la reunión del Consejo de Gobierno de la Junta celebrada el 26 de octubre y se publicó en el Boletín Oficial de Castilla y León del 27 de octubre. Según informó el portavoz del Gobierno autonómico, Carlos Fernández Carriedo, en la rueda de prensa posterior al Consejo, el director general de Administración Local, Emilio Arroita García, asumirá las funciones que desarrollaba Fernando Rubio.
Con su nombramiento, Rubio regresará al Ayuntamiento de Valladolid, del que salió en 2019 tras trece años en distintos puestos en el gobierno local o en la oposición. Precisamente, durante su etapa en el Consistorio, el ya exdirector de Acción Exterior tuvo un papel importante en la creación y constitución de la Agencia de Innovación y Desarrollo, pues ejerció como coordinador de la misma por delegación de la Alcaldía.
En 2015, Rubió formó parte de la lista electoral encabezada por el exalcalde Javier León de la Riva que ganó las elecciones pero sin mayoría absoluta por lo que, tras el pacto del resto de grupos pasó a integrar el grupo popular en la oposición.
A partir de ese año y hasta 2018, Rubio Ballestero también ejerció como jefe de gabinete de la exdelegada del Gobierno en Castilla y León, María José Salgueiro.
Entre 2019 y 2022 fue asesor en la Consejería de Agricultura, Ganadería y Desarrollo Rural junto al entonces consejero, Jesús Julio Carnero, que actualmente es el alcalde de Valladolid. Cuando carnero fue nombrado consejero de la Presidencia de la Junta en mayo de 2022, nombró a Fernando Rubio director de Acción Exterior, cargo que ahora deja para regresar al Ayuntamiento de Valladolid junto a Jesús Julio Carnero.